石墨模具清洗是石墨模具维护中的关键工序，也是制约石墨模具维护的瓶颈。因为石墨模具的制造研发速度比石墨模具的清洗速度快很多，而且石墨模具在快速清洗后还要马上准备下一次生产，所以留给石墨模具清洗的时间相当有限。通过对工厂的调查发现，工厂内走廊和车间的石墨模具几乎占据了车间有限的操作空间，就等着被清洗。
什么程度的干净才算够？

通常成型工艺完成后，总会有污物或残渣(具有一定的化学成分和物理特性)留在石墨模具上。对于不同种类的残留物，最终清洗的要求是不同的。PVC等树脂会产生氯化氢气体，会腐蚀多种类型的石墨模具钢。其他残留物从阻燃剂和抗氧化剂中分离出来，这些物质会腐蚀钢材。有些颜料和着色剂会使钢铁生锈，而且铁锈很难清除。即使是普通的密封水，如果放在石墨模具的未处理面上太久，也会对石墨模具造成损伤。